Одним из наиболее опасных заболеваний древесных растений является корневая гниль. В насаждениях основной плодовой культуры Северного Кавказа – яблони домашней в питомниках и молодых садах в последние годы стало отмечаться увеличение вредоносности почвенных токсиногенных грибов из рода Fusarium, а также рода Phytophthora. На территории Российской Федерации против корневой гнили яблони нет зарегистрированных препаратов. Следовательно, перспективным направлением исследований является поиск эффективных фунгицидов против этого заболевания. В связи с процессами экологизации систем защиты, а также с распространением технологий органического земледелия необходим подбор и разработка препаратов биологического происхождения, обеспечивающих многонаправленное действие против фитопатогенных грибов. Целью исследования являлось изучение в лабораторных условиях биологической эффективности различных микробиологических препаратов в отношении грибов рода Fusarium и Phytophthora, вызывающих развитие корневой гнили яблони. Препараты различались количеством и природой компонентов и содержали в своем составе как грибные, так и бактериальные организмы. Анализ биологической эффективности микробиологических препаратов in vitro осуществляли методом агаровых блоков с переворачиванием агаровой пластинки. Показано, что биоагенты препаратов «Агробиовит К1», Ж, «Витаплан», СП, «Споробактерин», СП и «Фитоспорин-М», Ж проявили антифунгальную активность в отношении возбудителей фузариозной и фитофторозной гнили корней яблони, их биологическая эффективность была от средней до высокой. Самая высокая активность в in vitro условиях в отношении трех изученных видов рода Fusarium была выявлена у экспериментального препарата «Агробиовит К1», Ж. В отношении изолята Phytophthora sp. наиболее эффективными оказались препараты «Витаплан», СП и «Споробактерин», СП. Также было показано, что многосоставные препараты имели более высокую эффективность в сравнении с односоставными, как и препараты, содержащие одновременно грибной и бактериальный компоненты.