vstispСадоводство и виноградарствоHorticulture and viticulture0235-25912618-9003Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»10.18454/VSTISP.2017.5.7586vstisp-186Research ArticleСЕЛЕКЦИЯ И СОРТОИСПЫТАНИЕGENETICS AND PLANT BREEDINGSSR-фингерпринтинг и оценка генетических взаимосвязей сортов персика современной селекции Никитского ботанического садаSSR-fi ngerprinting and estimation of genetic relationship of peach varieties of Nikita botanical gardens’ modern breedingСупрунИ. И.SuprunI. I.supruni@mail.ruСмыковА. В.SmykovA. V.noemail@neicon.ruТокмаковС. В.TokmakovS. V.kubansad@kubannet.ruФГБНУ «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»РоссияNorth-Caucasian Federal Scientifi c Center for Horticulture, Viticulture, Wine-makingRussian FederationФГБУН «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический сад - Национальный научный центр РАН»РоссияNikita botanical garden, Yalta, CrimeaRussian Federation201729072018052327Copyright © Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture», 20182018Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»https://www.sadivin.com/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.sadivin.com/jour/article/view/186

С использованием анализа полиморфизма микросателлитных локусов выполнена ДНК-паспортизация и оценка степени генетического сходства выборки из 20 современных сортов персика селекции Никитского ботанического сада. Исследованные сорта являются востребованными в садоводстве в агроклиматических условиях региона и представляют селекционный интерес как источники полезных адаптивных признаков. Для анализа полиморфизм исследуемых сортов использовали 13 SSR-маркеров: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 и BPPCT002. Маркеры были распределены в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Оптимальные сочетания SSR-маркеров позволили получать легко интерпретируемые результаты в ходе фрагментного анализа. Среди использованных SSR-маркеров наибольшее количество аллелей (5) было выявлено для маркеров BPPCT 025 и CPPCT 044, наименее полиморфными оказались маркеры CPPCT 040, UDP 98-409, BPPCT 028 (2 аллеля) и BPPCT002 (1 аллель). По остальным SSR-маркерам было выявлено по 3-4 аллеля на локус. Анализ полученных ДНК-фингерпринтов показал, что все изученные сорта обладают уникальным аллельным набором. Наиболее полиморфные SSR-маркеры перспективны для использования при ДНК-паспортизации генетических ресурсов персика. Выполненный кластерный анализ выявил три главных кластера, распределение в которых в ряде случаев согласуется с происхождением сортов. Данные о степени генетического сходства в совокупности с данными о происхождении сортов могут быть использованы для планирования комбинаций скрещиваний при необходимости получения максимального уровня разнообразия в гибридном потомстве.

By using of polymorphism analysis of microsatellite loci, DNA fi ngerprinting and an estimation of the degree of genetic similarity for a set of 20 modern peach varieties breeding of Nikita botanical garden were performed. The studied varieties are contributed for horticulture, agro-climatic conditions of the region and valuable for breeding interest as sources of useful adaptive traits. To analyze the polymorphism of studied varieties 13 SSR-markers were used: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 and BPPCT002. Markers were distributed in multiplex sets, which include from 3 to 4 markers. Optimal combinations of SSR-markers made it possible to obtain easily interpreted results during fragment analysis. Among the SSR markers used, the highest number of alleles (5) was identifi ed to markers BPPCT025 and CPPCT044, the least polymorphic markers were CPPCT040, UDP98-409, BPPCT028 (two alleles per locus) and BPPCT002 - one allele. The remaining SSR-markers revealed 3-4 alleles per locus. Analysis of the obtained DNA fi ngerprints showed that all studied peach varieties possess a unique allelic set. The most polymorphic SSR markers are promising for use in the DNA-fi ngerprinting of peach genetic resources. The cluster analysis revealed three main clusters, the distribution in which, in some cases, is consistent with the origin of the varieties. Genetic similarity data together with data on the origin of varieties can be used for planning of cross combinations as needed to maximize the diversity level in the hybrid offspring.

персикДНК-паспортизациямикросателлитные ДНК-маркерыаллельный полимор- физммультиплексный анализpeachDNA-fi ngerprintingmicrosatellite DNA-markersallelic polymorphismgenetic relationshipmultiplex analysisReferencesИсследования выполнены на оборудовании ЦКП «Геномные и постгеномные технологии», ФГБНУ СКФНЦСВВИсследования выполнены на оборудовании ЦКП «Геномные и постгеномные технологии», ФГБНУ СКФНЦСВВСмыков А. В., Федорова О. С., Шишова Т. В., Иващенко Ю. А. Селекция персика и ее результаты // Сб. научн. тр. ГНБС, 2015. - Т. 140. - С. 24-33.Смыков А. В., Федорова О. С., Шишова Т. В., Иващенко Ю. А. Селекция персика и ее результаты // Сб. научн. тр. ГНБС, 2015. - Т. 140. - С. 24-33.Aranzana M. J., Abbassi El-K., Howad W., Arus P. Genetic variation, population structure and linkage disequilibrium in peach commercial varieties // BMC Genetics, 2010. - Vol. 11:69. doi: 10.1186/1471-2156-11-69.Aranzana M. J., Abbassi El-K., Howad W., Arus P. Genetic variation, population structure and linkage disequilibrium in peach commercial varieties // BMC Genetics, 2010. - Vol. 11:69. doi: 10.1186/1471-2156-11-69.Zhongping C., Hongwen H. SSR fingerprinting of chinese peach cultivars and landraces (Prunus persica) and analysis of their genetic relationships // Scientia Horticulturae, 2009. - Vol. 120. - P. 188-193.Zhongping C., Hongwen H. SSR fingerprinting of chinese peach cultivars and landraces (Prunus persica) and analysis of their genetic relationships // Scientia Horticulturae, 2009. - Vol. 120. - P. 188-193.Aranzana M. J., Carbу J., Arus P. Microsatellite variability in peach [Prunus persica (L.) Batsch]: cultivar identifi cation, marker mutation, pedigree inferences and population structure // Theoretical and Applied Genetics, 2003. - Vol. 106. - P. 1341-1352.Aranzana M. J., Carbу J., Arus P. Microsatellite variability in peach [Prunus persica (L.) Batsch]: cultivar identifi cation, marker mutation, pedigree inferences and population structure // Theoretical and Applied Genetics, 2003. - Vol. 106. - P. 1341-1352.Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana M. J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach [Prunus persica (L.) Batsch] and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.) // Theoretical and Applied Genetics, 2002. - Vol. 125. - P. 127-138.Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana M. J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach [Prunus persica (L.) Batsch] and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.) // Theoretical and Applied Genetics, 2002. - Vol. 125. - P. 127-138.Bouhadida M., Casas A. M., Gonzalo M. J., Arus P., Moreno M. A., Gogorcena Y. Molecular characterization and genetic diversity of Prunus rootstocks // Scientia Horticulturae, 2009. - Vol. 120. - P. 37-245.Bouhadida M., Casas A. M., Gonzalo M. J., Arus P., Moreno M. A., Gogorcena Y. Molecular characterization and genetic diversity of Prunus rootstocks // Scientia Horticulturae, 2009. - Vol. 120. - P. 37-245.Супрун И. И., Токмаков С. В., Степанов И. В., Балапанов И. М. Разработка мультиплексных наборов SSRмаркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе: науч. труды ГНУ СКЗНИИ- СиВ, 2013. - Т. 1. - С. 97-101.Супрун И. И., Токмаков С. В., Степанов И. В., Балапанов И. М. Разработка мультиплексных наборов SSRмаркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе: науч. труды ГНУ СКЗНИИ- СиВ, 2013. - Т. 1. - С. 97-101.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.