vstispСадоводство и виноградарствоHorticulture and viticulture0235-25912618-9003Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»10.31676/0235-2591-2019-1-36-42vstisp-298Research ArticleМЕТОДЫ И СПОСОБЫ ЗАЩИТЫ РАСТЕНИЙ ОТ ВРЕДИТЕЛЕЙ И БОЛЕЗНЕЙMETHODS AND WAYS OF PROTECTING PLANTS FROM DISEAS AND PESTSСкрининговые методы выявления комплекса штаммов вируса шарки слив (PPV)Screening methods to identify the complex of strains of Plum pox virus (PPV)ПриходькоЮ. Н.PrikhodkoYu. N.

Кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник 

Адрес для переписки: Приходько Юрий Николаевич – ФГБУ «Всероссийский центр карантина растений», 140150, Россия, Московская область, Раменский район, пос. Быково-2, ул. Пограничная, 32

PhD (Agric.), Leader Researcher

Address for correspondence: Prikhodko Yuriy N. – All-Russian Plant Quarantine Center, 140150, Russia, Moscow region, Ramenskiy district, Bykovo-2, Pogranichnaya str., 32

prihodko_yuri59@mail.ruЖиваеваТ. С.ZhivaevaT. S.

Научный сотрудник

Reseacher

office@vniikr.ruШнейдерЮ. А.ShneyderYu. A.

Кандидат биологических наук, начальник отдела

Head of Department, PhD (Biol.)

office@vniikr.ruФГБУ «Всероссийский центр карантина растений»РоссияAll-Russian Plant Quarantine CentreRussian Federation201922032019013642Copyright © Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture», 20192019Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»https://www.sadivin.com/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.sadivin.com/jour/article/view/298

Из 10 известных штаммов вируса шарки слив (PPV) в Российской Федерации распространено 7 штаммов – D, M. Rec, W, C, CV и CR с преобладанием штаммов D и W. Характерной особенностью популяции вируса шарки слив в Российской Федерации является широкое распространение штаммов W, С и CR, исключительно редких или вовсе не обнаруженных в других регионах мира. Проведена отработка скрининговых тестов выявления комплекса штаммов PPV методами иммуноферментного анализа (ИФА) и полимеразной цепной реакции (ПЦР). Установлено, что эффективное выявление штаммов PPV-D, PPV-M, PPV-Rec, PPV-С, PPV-CR, PPV-EA, PPV-W и PPV-T достигается при использовании тест-систем для ИФА к PPV на основе поликлональных антител фирм ACD, Adgen, Agdia, Bioreba, DSMZ и Loewe. Моноклональные антитела 5B-IVIA не позволяют диагностировать изоляты, относящиеся к штамму PPV-CR. Для универсального выявления изолятов всех штаммов PPV необходимо использовать набор для ПЦР в реальном времени к PPV фирмы Синтол, набор для FLASH-ПЦР к PPV фирмы Агродиагностика или классическую ПЦР с одной из следующих пар праймеров: Р1/Р2, s1/as2 или 3´NCP sense/3´NCP antisense.

From the 10 known strains of thePlumpox virus (PPV) in the Russian Federation 7 strains are spread – D, M. Rec, W, C, CV, and CR with the prevalence of D and W strains. A characteristic feature of the Plum pox virus population in the Russian Federation is the wide spread of W, C and CR strains, extremely rare or not found at all in other regions of the world. Screening tests for detection of the complex of PPV strains by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and polymerase chain reaction (PCR) were carried out. It has been established that effective detection of PPV-D, PPV-M, PPV-Rec, PPV-C, PPV-CR, PPV-EA, PPV-W and PPV-T strains is achieved using PPV-ELISA test systems with polyclonal antibodies from ACD, Adgen, Agdia, Bioreba, DSMZ and Loewe companies. Monoclonal antibodies 5B-IVIA do not allow to diagnose isolates related to the strain PPV-CR. For universal detection of isolates of all PPV strains, it is necessary to use a real-time PCR kit for PPV (Syntol), a FLASH-PCR kit for PPV (Agrodiagnostica) or conventional PCR with one of the following primer pairs: P1/P2, s1/as2 or 3´NCP sense/3´NCP antisense.

вирус шарки сливштаммыиммуноферментный анализполимеразная цепная реакцияполиклональные антителамоноклональные антителанаборы реагентовпраймерыPlum pox virusstrainsenzyme-linked immunosorbent assaypolymerase chain reactionpolyclonal antibodiesmonoclonal antibodiesreagent kitsprimersReferencesSubr Z., Glasa M. Unfolding the secrets of plum pox virus: from epidemiology to genomics, Acta virologica. 2013;57:217-228.Subr Z., Glasa M. Unfolding the secrets of plum pox virus: from epidemiology to genomics, Acta virologica. 2013;57:217-228.James D., Varga A., Sanderson D. Genetic diversity of Plum pox virus: strains, diseases and related challenges for control, Canadian J. Plant Pathol. 2013;35:431-441.James D., Varga A., Sanderson D. Genetic diversity of Plum pox virus: strains, diseases and related challenges for control, Canadian J. Plant Pathol. 2013;35:431-441.Garcia J. A., Glasa M., Cambra M., Candresse T. Plum pox virus and sharka: model potyvirus and a major disease, Mol. Plant Pathol. 2014;15:226-241.Garcia J. A., Glasa M., Cambra M., Candresse T. Plum pox virus and sharka: model potyvirus and a major disease, Mol. Plant Pathol. 2014;15:226-241.Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Zakubanskiy A., Osipov G. New highly divergent Plum pox virus isolates infecting sour cherry in Russia, Virology. 2017;502:56-62.Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Zakubanskiy A., Osipov G. New highly divergent Plum pox virus isolates infecting sour cherry in Russia, Virology. 2017;502:56-62.Чирков С. Н., Приходько Ю. Н. Генетическое разнообразие и структура популяции вируса шарки (оспы) сливы в России, Сельскохозяйственная биология. 2015;50(5):529-539.Чирков С. Н., Приходько Ю. Н. Генетическое разнообразие и структура популяции вируса шарки (оспы) сливы в России, Сельскохозяйственная биология. 2015;50(5):529-539.Приходько Ю. Н., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А., Морозова О. Н., Мазурин Е. С. Выявление в Российской Федерации нового штамма вируса шарки слив – Cherry Russian (PPV-CR), Карантин растений. Наука и практика. 2013;2(4):18-26.Приходько Ю. Н., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А., Морозова О. Н., Мазурин Е. С. Выявление в Российской Федерации нового штамма вируса шарки слив – Cherry Russian (PPV-CR), Карантин растений. Наука и практика. 2013;2(4):18-26.Glasa M., Prikhodko Y., Predajňa L., Nagyová A., Shneyder Y., Zhivaeva T., Šubr Z., Cambra M., Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus, Phytopathology. 2013;103:972-979.Glasa M., Prikhodko Y., Predajňa L., Nagyová A., Shneyder Y., Zhivaeva T., Šubr Z., Cambra M., Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus, Phytopathology. 2013;103:972-979.EPPO, 2004. Diagnostic protocols for regulated pests. Plum pox Potyvirus, Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. 2004;34:247-256.EPPO, 2004. Diagnostic protocols for regulated pests. Plum pox Potyvirus, Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. 2004;34:247-256.МСФМ 27. Диагностические протоколы. ДП 2: Plum pox virus, Международная конвенция по карантину и защите растений. 2012. 22 с.МСФМ 27. Диагностические протоколы. ДП 2: Plum pox virus, Международная конвенция по карантину и защите растений. 2012. 22 с.Wetzel T., Candresse T., Ravelonandro M., Dunez J. A polymerase chain reaction assay adapted to plum pox potyvirus detection, Journal of Virological Methods. 1991;33:355-365.Wetzel T., Candresse T., Ravelonandro M., Dunez J. A polymerase chain reaction assay adapted to plum pox potyvirus detection, Journal of Virological Methods. 1991;33:355-365.Levy L., Hadidi A. A. Simple and rapid method for processing tissue infected with Plum pox potyvirus for use with specific 3’ non-coding region RT-PCR assays, EPPO Bull. 1994;24:595-604.Levy L., Hadidi A. A. Simple and rapid method for processing tissue infected with Plum pox potyvirus for use with specific 3’ non-coding region RT-PCR assays, EPPO Bull. 1994;24:595-604.Glasa M., Malinowski T., Predajňa L., Pupola N., Dekena D., Michalczuk L., Candresse T. Sequence variability, recombination analysis, and specific detection of the W strain of Plum pox virus, Phytopathology. 2011;101:980-985.Glasa M., Malinowski T., Predajňa L., Pupola N., Dekena D., Michalczuk L., Candresse T. Sequence variability, recombination analysis, and specific detection of the W strain of Plum pox virus, Phytopathology. 2011;101:980-985.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.