младший научный сотрудник, лаборатория селекционно-биотехнологическая,
Junior Researcher, Laboratory of Breeding and Biotechnolog
кандидат биологических наук, заведующий, лаборатория селекционно-биотехнологическая
PhD (Biol.), Head of the Laboratory, Laboratory of Breeding and Biotechnology
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, лаборатория флоры и растительных ресурсов
PhD (Biol.), Senior Researcher, Laboratory of Flora and Plant Resources
младший научный сотрудник, лаборатория селекционно-биотехнологическая
Junior Researcher, Laboratory of Breeding and Biotechnology
младший научный сотрудник, лаборатория флоры и растительных ресурсов
Junior Researcher, Laboratory of Flora and Plant Resources
Генетические исследования генофонда абрикоса обыкновенного различного географического происхождения способствуют накоплению сведений о путях распространения и истории возделывания данной культуры. Ценным материалом в подобных исследованиях выступает местная автохтонная геноплазма. К представителям автохтонного генофонда абрикоса обыкновенного можно отнести местные сорта Дагестана. Генетические исследования дагестанской геноплазмы позволят оценить её вклад в мировой генофонд абрикоса, а также определить её место среди сортов различного эколого-географического происхождения. Шесть SSR-маркеров, разработанных на абрикосе сибирском, были задействованы в генотипировании 12 сортов абрикоса обыкновенного. Значительная часть отобранных сортов была представлена местными дагестанскими формами. Использованные микросателлитные маркеры позволили разделить все отобранные для работы сорта как генотипы со специфичными SSR-профилями. Уровень полиморфизма, выраженный в количестве аллелей на локус, имел высокие значения, исходя из анализа ранее проведенных в мире исследований. В связи с этим можно заключить, что задействованные SSR-маркеры могут быть использованы в дальнейших работах, направленных на анализ генетического разнообразия исследуемой культуры. В ходе работы на основе данных, полученных при SSR-генотипировании, была проведена кластеризация сортов абрикоса обыкновенного с целью определения родственных групп сортов. В качестве способа, позволяющего осуществить кластерный анализ, был использован метод присоединения соседей (NJ). Кластеризация образцов, проведенная в работе, позволила выявить промежуточное положение дагестанских сортов относительно сортов различного эколого-географического происхождения. Для подтверждения полученных результатов дополнительно был использован метод главных координат PCoA, позволяющий на координатной плоскости отразить степень генетического родства образцов. Выявленные с помощью PCoA закономерности распределения образцов на графике координат в целом соответствовали данным кластеризации методом присоединения соседей (NJ). Проведенное исследование позволило оценить эффективность задействованных в работе SSR-маркеров для генотипирования сортов абрикоса обыкновенного и получить сведения о генетическом родстве местных дагестанских сортов с сортами из других эколого-географических групп.
Genetic studies of diff erent geographical origin of apricot varieties contribute to the accumulation of information about distribution and cultivation history of this crop. Valuable material in such studies is the local autochthonous germplasm. The local Dagestan varieties can be included to representatives of the autochthonous germplasm of apricot. Genetic studies of the Dagestan germplasm will allow to evaluate its contribution in world apricot gene pool, as well as to determine its place among varieties with diff erent eco-geographical origin. Six SSR- markers previously elaborated on Siberian apricots were used in the genotyping of 12 apricot varieties. Much of the selected varieties were represented by local Dagestan forms. Microsatellite markers used in this study allowed to separate all varieties selected for work as genotypes with specifi c SSR profi les. The polymorphism level, expressed in the number of alleles per locus, had high values, based on the analysis of studies previously conducted in the world. In this regard, we can conclude that the involved SSR markers can be used in further studies aimed at analyzing the genetic diversity of the studied culture. In this study, clustering apricot varieties was used to determine related groups of varieties, based on the data SSR-genotyping. For cluster analysis the neighbor joining (NJ) method was used. The clustering of the samples carried out in the work, allowed us to reveal the intermediate position of Dagestan varieties relative to varieties of diff erent eco-geographical origin. To confi rm the obtained results, the PCoA main coordinates method which refl ecting the relationship of genotyped samples on the coordinate plane was additionally used. The patterns of samples distribution on the plot of coordinates revealed by PCoA generally corresponded to the clustering data using the neighbor joining (NJ). The study made it possible to evaluate the eff ectiveness of the SSR-markers used in the work for the genotyping of apricot varieties and to obtain information on the genetic relatedness of the local Dagestan varieties relative to other eco-geographical groups of varieties.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.