Снижение эффективности хранения ягод малины тесно связано с потерей их качества, и в, первую очередь, от поражения грибными болезнями. Цель исследования — изучение микромицетного состава фитопатогенного комплекса на ягодах малины при хранении. Структура популяций грибных болезней оценивалась на ягодах шести сортов малины российской селекции (Клеопатра, Новость Кузьмина, Суламифь, Фрегат, Шахразада, Яркая) и трех — иностранной (Glen Lyon, Cascade Delight, Лимонная). Изучение хозяйственно-биологических особенностей сортов малины проводили по «Программе и методике сортоизучения плодовых, ягодных и орехоплодных культур» (1999), для выявления внешней и внутренней зараженности ягод малины применяли биологический метод (влажная камера), который основан на стимуляции развития и роста микроорганизмов в зараженных ягодах. Исследование видового состава микромицетных организмов на ягодах малины проводили по «Определителю болезней сельскохозяйственных культур» (1984) и «Болезням ягодников» (1963). Установлено, что на ягодах малины при хранении наиболее часто отмечаются виды гнилей: чёрная (Alternaria alternata (Fr) Keissler), сухая (Fusarium Link), кожистая (Phytophthora cactorum (Leb. et Cohn) Schroet), серая (Botrytis cinerea Pers.); плесени: черная (Cladosporium Link.), зелено-голубая (Penicillium Link), зелено-желтая (Aspergillus P. Micheliex Haller), серая головчатая (Rhizopus nigricans Ehrenb.), головчатая (Mucor spp.); загнивание костянок (Phragmidium rubi Wint.), бактериозы. Выявлено, что микробиота ягод исследуемых сортов малины при хранении была различной. Отмечено, что особое место среди патогенов занимали грибы pp. Fusarium и Alternaria. Доказано, что представители рода Fusarium практически во всех вариантах занимали лидирующее положение. Фитопатогенный комплекс представляли в основном грибы родов Fusarium, Alternaria и Penicillium. Определены сильно- (Суламифь, Шахразада, Новость Кузьмина) и слабовосприимчивые (Клеопатра) сорта малины к микромицетам, плоды которых закладывали на хранение.