vstispСадоводство и виноградарствоHorticulture and viticulture0235-25912618-9003Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»10.31676/0235-2591-2021-6-5-16vstisp-805Research ArticleГЕНЕТИКА, СЕЛЕКЦИЯ, СЕМЕНОВОДСТВОGENETICS, BREEDING, SEED PRODUCTIONНоменклатурные стандарты и генетические паспорта сортов яблони селекции Крымской опытно-селекционной станции ВИРNomenclature standards and DNA barcoding of apple varieties originated by VIR Crimean Experimental Breeding Stationhttps://orcid.org/0000-0003-0768-0056БагметЛ. В.BagmetL. V.

Багмет Лариса Владимировна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, отдел агроботаники и сохранения in situ генетических ресурсов растений

ул. Большая Морская, 42, 44, Санкт-Петербург, 190031

Larisa V. Bagmet, PhD (Biol.), Leading Researcher, Department of Agrobotany and in situ Conservation of Plant Genetic Resources

42, 44 Bolshaya Morskaya Str., Saint Petersburg, 190031

herbar@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7215-9908ЧепиногаИ. С.ChepinogaI. S.

кандидат сельскохозяйственных наук, старший научный сотрудник

Крымск

PhD (Agric.), Senior Researcher

Krymsk, Krasnodar Territory

https://orcid.org/0000-0001-9618-5932ТрифоноваА. А.TrifonovaA. A.

кандидат биологических наук, научный сотрудник, лаборатория генетики растений

Москва

PhD (Biol.), Researcher, Plant Genetics Laboratory

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-8479-4949БорисК. В.BorisK. V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, лаборатория генетики растений

Москва 

PhD (Biol.), Senior Researcher, Plant Genetics Laboratory

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-8009-6780ШлявасА. В.ShlyavasA. V.

младший научный сотрудник отдела генетических ресурсов плодовых культур

Санкт-Петербург

Junior Researcher, Department of Genetic Resources of Fruit Crops

St. Petersburg

Федеральный исследовательский центр «Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н. И. Вавилова» (ВИР)РоссияFederal Research Center N. I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR)Russian FederationКрымская ОСС — филиал ФИЦ «Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н. И. Вавилова» (ВИР)РоссияKrymsk Experimental Breeding Station — Branch of the Federal Research Center N. I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR)Russian FederationИнститут общей генетики им. Н. И. Вавилова Российской академии наукРоссияVavilov Institute of General Genetics of the Russian Academy of SciencesRussian Federation20213012202106516Copyright © Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture», 20212021Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»Autonomous non-profit organization Editorial Board of journal «Horticulture and viticulture»https://www.sadivin.com/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.sadivin.com/jour/article/view/805

Современный уровень развития селекции и внедрение новых технологий требует усиления контроля за качеством и подлинностью селекционных достижений. В этих условиях особую актуальность приобретает создание номенклатурных стандартов сортов как хранилища оригинальной генетической информации, подтверждающей подлинность селекционного продукта. Номенклатурный стандарт закрепляет название сорта и фиксирует его внешний вид. Для этого документа наиболее подходит гербарный образец, так как именно он несет набор стабильно наследуемых морфологических признаков сорта. Номенклатурные стандарты должны передаваться на вечное хранение в научную гербарную коллекцию. Во Всероссийском институте генетических ресурсов растений (Санкт-Петербург) совместно с отечественными селекционерами впервые в России начата работа по созданию коллекции номенклатурных стандартов сортов российской селекции культурных растений. Помимо применения классических методов гербаризации для формирования этой коллекции используются и молекулярно-генетические методы, в частности, генотипирование, которое расширяет возможности верификации сортов. Созданы номенклатурные стандарты шести сортов яблони, выведенных в Крымской опытно-селекционной станции — филиале ВИР (Белое Солнце, Золотой Поток, Кубаночка, Лето Красное, Лучистое, Щедрость). Номенклатурные стандарты дополнены генетическими паспортами, полученными в сотрудничестве с Институтом общей генетики им. Н. И. Вавилова (Москва). Для создания паспортов были использованы 15 микросателлитных маркеров. Гербарные образцы номенклатурных стандартов оформлены по протоколу, разработанному в ВИР в соответствии с рекомендациями Международного кодекса номенклатуры культурных растений (ICNCP). Они зарегистрированы в базе данных «Гербарий ВИР» и переданы на хранение в типовой фонд Гербария культурных растений мира, их диких родичей и сорных растений (WIR).

Current pace of breeding technologies relies on a tighter control of quality and identity of breeding achievements. Thereby, standardised variety nomenclature becomes of particular relevance to store original genetic information and warrant authenticity of the breeding product. A nomenclature standard regulates the variety’s name and habitus. A herbarium specimen is most appropriate for standardisation, since it defines a set of strongly inherited morphological characters for a variety. Nomenclature standards must be permanently stored in a scientific herbarium collection. The N. I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR) in alliance with national plant breeders initiated a first nomenclature standard collection of national-breeding cultivars. Aside to classical herbarising, the collection utilises molecular genetic techniques, particularly genotyping, to enable extended variety verification. The VIR team has developed the nomenclature standards of six apple varieties originated by the Crimean Experimental Breeding Station, a VIR Branch (Beloe Solntse, Zolotoy Potok, Kubanochka, Leto Krasnoe, Luchistoe and Shchedrost). The standards are supplemented with DNA barcodes obtained jointly with the N. I. Vavilov Institute of General Genetics. Fifteen microsatellite markers were used for barcoding. The herbarium nomenclature specimens adhered to the VIR-developed protocol in accordance with the International Code of Nomenclature for Cultivated Plants (ICNCP). The specimens are registered in the VIR Herbarium database and deposited in the World Crop Wild and Weed Relatives (WIR) Herbarium type collection.

Malus domestica BorkhГербарий культурных растений мираих диких родичей и сорных растений (WIR)культурная флораприкладная ботаникагенотипированиемикросателлитные маркерыMalus domestica Borkh.World Crop Wild and Weed Relatives (WIR) Herbariumcrop floraapplied botanygenotypingmicrosatellite markersРабота выполнена в рамках государственного задания, согласно бюджетным проектам ВИР по теме № 0662-2020-0004 «Коллекции ВИР вегетативно размножаемых культур (картофель, плодовые, ягодные, декоративные, виноград) и их диких родичей — изучение и рациональное использование» с использованием Гербария культурных растений мира, их диких родичей и сорных растений (WIR) и при поддержке гранта РФФИ 17-29-08020.The work was carried out within the framework of the state task according to the budget projects of the WIR on the topic No. 0662-2020-0004 “Collections of VIR vegetatively propagated crops (potatoes, fruit, berry, ornamental, grapes) and their wild relatives — study and rational use” using the Herbarium of cultivated plants of the world, their wild relatives and weeds (WIR) and with the support of the RFBR grant 17-29-08020ReferencesКрымская опытно-селекционная станция: (к 75-летию образования): ред. коллегия: В. Г. Еремин [и др.]. Крымск: 2010, 5-20.Krymsk experimental breeding station: (to the 75th anniversary of creation): ed. collegium: V. G. Eremin [and others]. Krymsk: 2010, 5-20. (In Russ.)Гавриленко Т. А., Чухина И. Г. Номенклатурные стандарты современных российских сортов картофеля, хранящиеся в гербарии ВИР (WIR): новые подходы к регистрации сортового генофонда в генбанках. Биотехнология и селекция растений. 2020;3(3):6-17. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o2Gavrilenko T. A., Chukhina I. G. Nomenclature standards of modern Russian potato varieties stored in the VIR herbarium (WIR): new approaches to registration of varietal gene pool in genebanks. Biotekhnologiya i selektsiya rasteniy. 2020;3(3):6-17. (In Russ.) DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o2Клименко Н. С., Гавриленко Т. А., Чухина И. Г., Гаджиев Н. М., Евдокимова З. З., Лебедева В. А. Номенклатурные стандарты и генетические паспорта сортов картофеля селекции Ленинградского НИИСХ «Белогорка». Биотехнология и селекция растений. 2020;3(3):18-54. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o3Klimenko N. S., Gavrilenko T. A., Chukhina I. G., Gadzhiev N. M., Evdokimova Z. Z., Lebedeva V. A. Nomenclature standards and genetic passports of potato varieties of the Leningrad Research Institute of Agriculture «Belogorka». Biotekhnologiya i selektsiya rasteniy. 2020;3(3):18-54. (In Russ.) DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o3Фомина Н. А., Антонова О. Ю., Чухина И. Г., Гимаева Е. А., Сташевски З., Гавриленко Т. А. Номенклатурные стандарты и генетические паспорта сортов картофеля селекции Татарского НИИСХ «Казанский научный центр РАН». Биотехнология и селекция растений. 2020;3(3):55-67. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o4Fomina N. A., Antonova O. Yu., Chukhina I. G., Gimaeva E. A., Stashevsky Z., Gavrilenko T. A. Nomenclature standards and genetic passports of potato varieties bred by the Tatar Research Institute of Agriculture “Kazan Scientific Center of the Russian Academy of Sciences”. Biotekhnologiya i selektsiya rasteniy. 2020;3(3):5567. (In Russ.) DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o4Багмет Л. В., Шлявас А. В. Номенклатурные стандарты сортов яблони селекции Павловской опытной станции ВИР. Vavilovia. 2021;4(1):3-24. DOI: 10.30901/2658-3860-2021-1-3-2Bagmet L. V., Shlyavas A. V. Nomenclature standards of apple varieties bred by the Pavlovsk Experimental Station VIR. Vavilovia. 2021;4(1):3-24. (In Russ.) DOI: 10.30901/2658-3860-2021-1-3-2Шлявас А. В., Тележинский Д. Д., Багмет Л. В. Номенклатурные стандарты сортов яблони селекции Свердловской селекционной станции садоводства. Часть 1. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2021;182(4):9-14. DOI: 10.30901/2227-8834-2021-4-9-14Shlyavas A. V., Telezhinsky D. D., Bagmet L. V. Nomenclature standards of apple varieties bred by the Sverdlovsk horticultural station. Part 1. Trudy po prikladnoy botanike, genetike i selektsii. 2021;182(4):9-14. (In Russ.) DOI: 10.30901/2227-8834-2021-4-9-14Urrestarazu J., Denance C., Ravon E., Guyader A., Guisnel R., Feugey L., Poncet C., Lateur M., Houben P., Ordidge M., Fernandez-Fernandez F., Evans K. M., Paprstein F., Sedlak J., Nybom H., Garkava-Gustavsson L., Miranda C., Gassmann,J., Kellerhals M., Durel C. E. Analysis of the genetic diversity and structure across a wide range of germplasm reveals prominent gene flow in apple at the European level. BMC Plant Biol. BMC Plant Biology. 2016;16(1):1-20.Urrestarazu J., Denance C., Ravon E., Guyader A., Guisnel R., Feugey L., Poncet C., Lateur M., Houben P., Ordidge M., Fernandez-Fernandez F., Evans K. M., Paprstein F., Sedlak J., Nybom H., Garkava-Gustavsson L., Miranda C., Gassmann,J., Kellerhals M., Durel C. E. Analysis of the genetic diversity and structure across a wide range of germplasm reveals prominent gene flow in apple at the European level. BMC Plant Biol. BMC Plant Biology. 2016;16(1):1-20.Baric S., Storti A., Hofer M., Guerra W., Dalla Via J. Molecular Genetic Identification of Apple Cultivars Based on Microsatellite DNA Analysis. I. The Database of 600 Validated Profiles. ErwerbsObstbau. 2020;62:117-154. DOI:10.1007/s10341-020-00483-0.Baric S., Storti A., Hofer M., Guerra W., Dalla Via J. Molecular Genetic Identification of Apple Cultivars Based on Microsatellite DNA Analysis. I. The Database of 600 Validated Profiles. ErwerbsObstbau. 2020;62:117-154. DOI:10.1007/s10341-020-00483-0Shlyavas A. V., Trifonova A. A., Shamshin I. N., Boris K. V., Kudryavtsev A. M. Genetic diversity of apple landraces from VIR collection based on SSR markers. Acta Hortic. 2021;1307:105-108. DOI: 10.17660/ActaHortic.2021.1307.16Shlyavas A. V., Trifonova A. A., Shamshin I. N., Boris K. V., Kudryavtsev A. M. Genetic diversity of apple landraces from VIR collection based on SSR markers. Acta Hortic. 2021;1307:105-108. DOI: 10.17660/ActaHortic.2021.1307.16Белозор Н. И. Гербаризация культурных растении (Методические указания). Ленинград: ВИР, 1989, 56 с.Belozor NI Herbarization of cultivated plants (Methodical instructions). Leningrad: VIR, 1989, 56 p. (In Russ.)Широкий унифицированный классификатор СЭВ подсемейства Maloideae родов Malus Mill., Pyrus L., Cydonia Mill. СССР. Ленинград: 1989, 37 с.Wide unified CMEA classifier of the Maloideae subfamily of the genera Malus Mill., Pyrus L., Cydonia Mill. THE USSR. Leningrad: 1989, 37 p. (In Russ.)Атлас лучших сортов плодовых и ягодных культур Краснодарского края. Т. 1. Яблоня. Под ред. Г. В. Ерёмина. Краснодар: 2008, 104 с.Atlas of the best varieties of fruit and berry crops of the Krasnodar Territory. Vol. 1. Apple tree. Ed. G. V. Eremin. Krasnodar: 2008, 104 p. (In Russ.)Помология: в 5 томах. Т. 1. Яблоня: под ред. Е. Н. Седова. М: 2005, 574 с.Pomology: in 5 volumes. Vol. 1. Apple tree: ed. E. N. Sedov. Moscow: 2005, 574 p.Brickell C. D., Alexander C., Cubey J. J., David J. C., Hoffman M. H. A., Leslie A. C., Malecot V., Xiaobai Jin. International code of nomenclature for cultivated plants. Ed. 9. Scripta Horticulturae. 2016;18:1–27.Brickell C. D., Alexander C., Cubey J. J., David J. C., Hoffman M. H. A., Leslie A. C., Malecot V., Xiaobai Jin. International code of nomenclature for cultivated plants. Ed. 9. Scripta Horticulturae. 2016;18:1–27.Gianfranceschi L., Seglias N., Tarchini R., Komjanc M., Gessler C. Simple sequence repeats for the genetic analysis of apple. Theor. Appl. Genet. 1998;96:1069-1076. DOI: 10.1007/s001220050841Gianfranceschi L., Seglias N., Tarchini R., Komjanc M., Gessler C. Simple sequence repeats for the genetic analysis of apple. Theor. Appl. Genet. 1998;96:1069-1076. DOI: 10.1007/s001220050841Liebhard R., Gianfranceschi L., Koller B., Ryder C. D., Tarchini R., Van de Weg E., Gessler C. Development and characterization of 140 new microsatellites in apple (Malus × domestica Borkh.). Molecular Breeding. 2002;10:217-241. DOI: 10.1023/A:1020525906332Liebhard R., Gianfranceschi L., Koller B., Ryder C. D., Tarchini R., Van de Weg E., Gessler C. Development and characterization of 140 new microsatellites in apple (Malus × domestica Borkh.). Molecular Breeding. 2002;10:217-241. DOI: 10.1023/A:1020525906332Vinatzer B. A., Patocchi A., Tartarini S., Gianfranceschi L., Sansavini S., Gessler C. Isolation of two microsatellite markers from BAC clones of the Vf scab resistance region and molecular characterization of scab-resistant accessions in Malus germplasm. Plant Breed. 2004;123(4):321-326. DOI: 10.1111/j.1439-0523.2004.00973.xVinatzer B. A., Patocchi A., Tartarini S., Gianfranceschi L., Sansavini S., Gessler C. Isolation of two microsatellite markers from BAC clones of the Vf scab resistance region and molecular characterization of scab-resistant accessions in Malus germplasm. Plant Breed. 2004;123(4):321-326. DOI: 10.1111/j.1439-0523.2004.00973.x

The authors declare that there are no conflicts of interest present.