Журнал начал издаваться Российским обществом любителей садоводства в Москве в 1838 г. под названием "Журнал садоводства".

С 1859 по 1988 гг. журнал неоднократно изменял свое название. С 1988 г. по настоящее время выходит под названием "Садоводство и виноградарство". В 2014 г. в связи с переименованием учредителя, журнал был перерегистрирован в Федеральной службе по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (№ФС77-59887). В 1988 г. журнал получил Международный стандартный серийный номер –ISSN 0235-2591. В 2011 г. в Конгресс-центре (Москва) Торгово-промышленной палаты РФ в рамках делового форума "Качественная пресса России и перспективы ее развития", при поддержке Федерального Агентства по печати и массовым коммуникациям журнал «Садоводство и виноградарство» был награжден Знаком отличия «Золотой фонд прессы-2011».

Журнал в настоящее время внесен в базы данных RSCI (Russian Science Citation Index на платформе Web Science), CABI (Centre for Agricultural Bioscience International), Международной информационной системы по сельскому хозяйству и смежным с ним отраслям AGRIS (Agricultural Research Information System), включен в Российский индекс научного цитирования (РИНЦ).
По состоянию на апрель 2018 года согласно данным анализа «Российского индекса научного цитирования» (РИНЦ) двухлетний импакт-фактор для журнала «Садоводство и виноградарство»  составил – 0,842, а пятилетний – 0,573, при показателе самоцитируемости 14 % (подробная информация на сайте: www.elibrary.ru)