Скрининговые методы выявления комплекса штаммов вируса шарки слив (PPV)

Из 10 известных штаммов вируса шарки слив (PPV) в Российской Федерации распространено 7 штаммов – D, M. Rec, W, C, CV и CR с преобладанием штаммов D и W. Характерной особенностью популяции вируса шарки слив в Российской Федерации является широкое распространение штаммов W, С и CR, исключительно редких или вовсе не обнаруженных в других регионах мира. Проведена отработка скрининговых тестов выявления комплекса штаммов PPV методами иммуноферментного анализа (ИФА) и полимеразной цепной реакции (ПЦР). Установлено, что эффективное выявление штаммов PPV-D, PPV-M, PPV-Rec, PPV-С, PPV-CR, PPV-EA, PPV-W и PPV-T достигается при использовании тест-систем для ИФА к PPV на основе поликлональных антител фирм ACD, Adgen, Agdia, Bioreba, DSMZ и Loewe. Моноклональные антитела 5B-IVIA не позволяют диагностировать изоляты, относящиеся к штамму PPV-CR. Для универсального выявления изолятов всех штаммов PPV необходимо использовать набор для ПЦР в реальном времени к PPV фирмы Синтол, набор для FLASH-ПЦР к PPV фирмы Агродиагностика или классическую ПЦР с одной из следующих пар праймеров: Р1/Р2, s1/as2 или 3´NCP sense/3´NCP antisense.

1. Subr Z., Glasa M. Unfolding the secrets of plum pox virus: from epidemiology to genomics, Acta virologica. 2013;57:217-228.

2. James D., Varga A., Sanderson D. Genetic diversity of Plum pox virus: strains, diseases and related challenges for control, Canadian J. Plant Pathol. 2013;35:431-441.

3. Garcia J. A., Glasa M., Cambra M., Candresse T. Plum pox virus and sharka: model potyvirus and a major disease, Mol. Plant Pathol. 2014;15:226-241.

4. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Zakubanskiy A., Osipov G. New highly divergent Plum pox virus isolates infecting sour cherry in Russia, Virology. 2017;502:56-62.

5. Чирков С. Н., Приходько Ю. Н. Генетическое разнообразие и структура популяции вируса шарки (оспы) сливы в России, Сельскохозяйственная биология. 2015;50(5):529-539.

6. Приходько Ю. Н., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А., Морозова О. Н., Мазурин Е. С. Выявление в Российской Федерации нового штамма вируса шарки слив – Cherry Russian (PPV-CR), Карантин растений. Наука и практика. 2013;2(4):18-26.

7. Glasa M., Prikhodko Y., Predajňa L., Nagyová A., Shneyder Y., Zhivaeva T., Šubr Z., Cambra M., Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus, Phytopathology. 2013;103:972-979.

8. EPPO, 2004. Diagnostic protocols for regulated pests. Plum pox Potyvirus, Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. 2004;34:247-256.

9. МСФМ 27. Диагностические протоколы. ДП 2: Plum pox virus, Международная конвенция по карантину и защите растений. 2012. 22 с.

10. Wetzel T., Candresse T., Ravelonandro M., Dunez J. A polymerase chain reaction assay adapted to plum pox potyvirus detection, Journal of Virological Methods. 1991;33:355-365.

11. Levy L., Hadidi A. A. Simple and rapid method for processing tissue infected with Plum pox potyvirus for use with specific 3’ non-coding region RT-PCR assays, EPPO Bull. 1994;24:595-604.

12. Glasa M., Malinowski T., Predajňa L., Pupola N., Dekena D., Michalczuk L., Candresse T. Sequence variability, recombination analysis, and specific detection of the W strain of Plum pox virus, Phytopathology. 2011;101:980-985.