Preview

Садоводство и виноградарство

Расширенный поиск

ДНК-профилирование аборигенного абхазского сорта винограда «Качич»

https://doi.org/10.31676/0235-2591-2019-6-9-13

Полный текст:

Аннотация

Изучение аборигенного генофонда Vitis vinifera L. различных зон виноградарства с привлечением молекулярногенетических методов – актуальная задача изучения большого разнообразия сортов винограда. Территория Абхазии – уникальная зона, один из очагов возникновения культурного винограда. «Качич» – древнейший абхазский сорт винограда, известен благодаря высокому качеству вин, получаемых из его урожая. Сорт более устойчив к грибным заболеваниям по сравнению с популярными европейскими формами, возделываемыми в условиях современной Абхазии, и особо устойчив к гнилям ягод. Однако часто местное население называет именем «Качич» стародавние кусты, дающие виноград хорошего качества для приготовления красных вин, не всегда соответствующий морфологическому описанию сорта. Цель исследований – ДНК-паспортизация сорта винограда «Качич» на основе анализа полиморфизма микросателлитных локусов. Объектом исследования являлись растения, соответствующие сортовому описанию, произрастающие в коллекции агрофирмы ООО «Вина и воды Абхазии» (Сухум, Абхазия). ДНК выделяли из молодых листьев верхушки побега типичных растений сорта методом ЦTAБ. Генотипирование проведено на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР) с разделением продуктов реакции методом капиллярного электрофореза. В исследовании использовали высокополиморфные SSR-маркеры, рекомендованные для сортовой идентификации винограда (VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD25, VVMD27, VVMD28, VVMD32, VrZAG62, VrZAG79). Оценка размера амплифицированных фрагментов проведена с использованием автоматического генетического анализатора ABI Prism 3130 и специального программного обеспечения GeneMapper и PeakScanner. Для уточнения размеров амплифицированных фрагментов в работе использовали ДНК референсных сортов. По результатам микросателлитного анализа составлен ДНК-паспорт генотипа сорта винограда «Качич» – VVS2153 155 VVMD5234 240 VVMD7239 249 VVMD25239 267 VVMD27186 193 VVMD28234 248 VVMD32262 272 VrZAG62194 196 VrZAG79236 236. Полученный ДНК-профиль был проверен на предмет совпадений в международной базе Vitis International Variety Catalogue VIVC. Совпадений полученного ДНК-профиля с каким-либо иным ДНК-профилем из представленных в базе данных не выявлено. ДНК-паспорт генотипа «Качич» может быть успешно использован для сортовой идентификации растений винограда при необходимости уточнения их сортовой принадлежности.

Об авторах

Е. Т. Ильницкая
ФГБНУ «Северо-Кавказский Федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия

Ильницкая Елена Тарасовна – кандидат биологических наук, заведующая лабораторией сортоизучения и селекции винограда

 ул. им. 40-летия Победы, 39, Краснодар, 350901



В. Ш. Айба
ГНУ «Институт сельского хозяйства Академии наук Абхазии»
Абхазия

Кандидат сельскохозяйственных наук, заведующий отделом виноградарства и микровиноделия

Сухум


М. В. Макаркина
ФГБНУ «Северо-Кавказский Федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия

Младший научный сотрудник, лаборатория сортоизучения и селекции винограда

Краснодар


С. В. Токмаков
ФГБНУ «Северо-Кавказский Федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия

Кандидат биологических наук, научный сотрудник, лаборатория селекционно-биотехнологическая

Краснодар


М. А. Авидзба
ГНУ «Институт сельского хозяйства Академии наук Абхазии»
Абхазия

Заведующая отделом плодоводства

Сухум


Список литературы

1. Possingham J. V. Developments in the production of table grapes, wine and raisins in tropical regions of the world, Acta Horticulturae. 2006;785:45-50. DOI: 10.17660/ActaHortic.2008.785.1.

2. Reisch B. Genetic resources and breeding: current status and shifting paradigms: abstract book of XII International Conference on Grapevine Breeding and Genetics (GBG), 15-20 July, Bordeaux, France, 2018, 31.

3. Рухадзе Л. П., Соловьев Б. Л. Голоценовая флора погребенных торфяников Сухуми, Труды сухумского ботанического сада. 1964;15:101-112.

4. Лордкипанидзе О. Л. Наследие древней Грузии. Тбилиси: Мецниереба, 1989, 436 с.

5. Вавилов Н. И. Центры происхождения культурных растений, Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 1926;26(2):248.

6. Инал-ипа Ш. Д. Об абхазских нартских сказаниях, Труды АбНИИ. 1949;23:23-25.

7. Кварацхелия Ф. К. К изучению абхазских сортов винограда. Сухум: Абвинтрест, 1934, 36 c.

8. Бгажба М. Т. Растительные ресурсы Абхазии и их использование. Сухуми: Алашара, 1964, 576 с.

9. Чамагуа Е. И. Виноград Абхазии. Сухуми: Алашара, 1968, 222 c.

10. This P., Jung A., Boccacci P., Borrego J., Botta R., Costantini L., Crespan M., Dangl G. S., Eisenheld C., Ferreira-Monteiro F., Grando S., Iba´n˜ez J., Lacombe T., Laucou V., Magalha˜es R., Meredith C.P., Milani N., Peterlunger E., Regner F., Zulini L., Maul E. Development of a standard set of microsatellite reference alleles for identifi cation of grape cultivars, Theor. Appl. Genet. 2004;109:1448-1458. DOI: 10.1007/s00122-004-1760-3.

11. Akkak A., Boccacci P., Botta R. «Cardinal» grape parentage: a case of a breeding mistake, Genome. 2007;50:325-328. DOI: 10.1139/G06-145.

12. Storchi P., Armanni A., Randellini L., Giannetto S., Meneghetti S., Crespan M. Investigations on the identity of «Canaiolo bianco» and other white grape varieties of central Italy, Vitis. 2011;50(2):59-64.

13. Гориславец С. М., Рисованная В. И., Спотарь Г. Ю., Володин В. А. Генотипирование сорта винограда Бессемянный Магарача и анализ его происхождения с использованием SSRмаркеров, Магарач. Виноградарство и виноделие. 2018;4(106):1921.

14. Ильницкая Е. Т., Макаркина М. В., Токмаков С. В. Уточнение происхождения некоторых сортов винограда отечественной селекции по микросателлитным профилям, Плодоводство и виноградарство Юга России. 2019;59(5):12-20. DOI: 10.30679/2219-5335-2019-5-59-12-20

15. Basheer-Salimia R., Lorenzi S., Batarseh F., Moreno-Sanz P., Emanuelli F., Grando M. S. Molecular identifi cation and genetic relationships of Palestinian grapevine cultivars, Molecular biotechnology. 2014;56(6):546-556. DOI: 10.1007/s12033-013-9728-7.

16. Labagnara T., Bergamini C., Caputo A.R., Cirigliano P. Vitis vinifera L. germplasm diversity: a genetic and ampelometric study in ancient vineyards in the South of Basilicata region (Italy), Vitis. 2018;57(1):1-8. DOI: 10.5073/vitis.2018.57.1-8.

17. Ильницкая Е. Т., Наумова Л. Г., Ганич В. А., Токмаков С. В., Макаркина М. В. Генетический полиморфизм редких и малораспространенных аборигенных донских генотипов Vitis vinifera L., Магарач. Виноградарство и виноделие. 2019;21.3(109):191-197. DOI: 10.35547/IM.2019.21.3.002.

18. Mandić A., Žulj Mihaljević M., Leko M., Primorac J., Beljo J. Synonyms and homonyms in Herzegovinian and Dalmatian grapevine cultivars, Acta Horticulturae. 2019;1248:15-20. DOI: 10.17660/ActaHortic.2019.1248.3.

19. Ампелография СССР. Т. 3 / под ред. А. М. Фролова-Багрева. М.: Пищепромиздат. 1954, 396 с.

20. Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummifi ed plant tissues, Plant Molecular Biology. 1985;19(1):69-76.

21. Julius Kuhn-Institut. International Variety Catalogue VIVC, URL: http://www.vivc.de. Ссылка активна на 09.10.2019.


Для цитирования:


Ильницкая Е.Т., Айба В.Ш., Макаркина М.В., Токмаков С.В., Авидзба М.А. ДНК-профилирование аборигенного абхазского сорта винограда «Качич». Садоводство и виноградарство. 2019;(6):9-13. https://doi.org/10.31676/0235-2591-2019-6-9-13

For citation:


Ilnitskaya E.T., Ayba V.S., Makarkina M.V., Tokmakov S.V., Avidzba M.A. DNA-fi ngerprinting of local Аbkhazian grape variety Kachich. Horticulture and viticulture. 2019;(6):9-13. (In Russ.) https://doi.org/10.31676/0235-2591-2019-6-9-13

Просмотров: 367


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0235-2591 (Print)
ISSN 2618-9003 (Online)