|Generate QR code
Open Access
Subscription Access
Degree estimation of polymorphism of SSR-markers for varietal identification of Persian walnut
Abstract
The analysis of polymorphism of eleven varieties and pre-selection forms of Persian walnut by two microsatellite loci is spent. Studied varieties and forms of walnut are adapted to the agro-climatic conditions of the North Caucasus and the Kuban regions and are breeding interest as sources of useful adaptive traits. For analysis we used primer pairs WGA069 and WGA202, obtained during the sequencing of the genome of black walnut. These markers were tested on DNA walnut and reported in the literature showed high polymorphism alleles, which led to their inclusion in the work. According to the literature, the range of size PCR products with markers WGA069, WGA202 and do not overlap, which allowed them to be grouped in a multiplex set. Level of polymorphism of two loci allowed to obtain individual SSR-profiles with unique set of alleles for all studied varieties.
Keywords
About the Authors
I. M. Balapanov
North Caucasian Regional Scientifi c Institute of Horticulture and Viticulture
Russian Federation
Russian Federation
S. V. Tokmakov
North Caucasian Regional Scientifi c Institute of Horticulture and Viticulture
Russian Federation
Russian Federation
I. V. Stepanov
North Caucasian Regional Scientifi c Institute of Horticulture and Viticulture
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Арклис О.В., Высоцкий В.А., Цветков И.Л. Идентификация косточковых культур с помощью молекулярных маркеров // Биотехнология: состояние и перспективы развития: матер. III Моск. межд. конгресса. (Москва, 14-18 марта 2005 г.), 2005. - Ч. 1. - С. 223.
2. Балапанов И.М., Луговской А.П. Латеральное плодоношение в селекции ореха грецкого // Плодоводство и виноградарство Юга России, 2014. - № 27 (03). - С. 135-140.
3. Зайцев В.С., Мицых Д.Н., Хавкин Э.Е. ДНК-генотипирование сортообразцов вишни и черешни // Сельскохозяйственная биология, 2005. - № 3. - С. 123-125.
4. Романова О.В., Высоцкий В.А. Методика молекулярно-генетической идентификации сортов косточковых культур. - М.: ГНУ ВСТИСП, 2007. - 70 с.
5. Супрун И.И., Токмаков С.В., Малюченко О.П. и др. Генотипирование сортов яблони российской селекции с использованием микросателлитных маркеров // Известия ТСХА, 2011. - №6. - С. 162-166.
6. Супрун И.И., Токмаков С.В., Ильницкая Е.Т. и др. ДНК-фингерпринтинг сортов черешни селекции СКЗНИИСиВ с использованием анализа полиморфизма микросателлитных локусов // Садоводство и виноградарство, 2014. - № 2. - С. 24-27.
7. Супрун И.И., Токмаков С.В., Степанов И.В. и др. Разработка мультиплексных наборов SSR-маркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе: науч. тр. ГНУ СКЗНИИСиВ. - Краснодар, 2013. -Т. 1. - С. 97-101.
8. Ульяновская Е.В., Супрун И.И., Седов Е.Н. и др. Создание иммунных к парше генотипов яблони с комплексом ценных агробиологических признаков // Плодоводство и виноградарство Юга России, 2011. - № 10 (4). - С. 14-30.
9. Dangl G.S. et al. Characterization of 14 microsatellite markers for genetic analysis and cultivar identification of walnut // Journal of the American Society for Horticultural Science, 2005. - Vol. 130. - № 3. - P. 348-354.
10. Murray M.G., Thompson W.F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA // Nucleic acids research, 1980. - Vol. 8, №. 19. - P. 4321-4326.
Review
For citations:
Balapanov I.M., Tokmakov S.V., Stepanov I.V. Degree estimation of polymorphism of SSR-markers for varietal identification of Persian walnut. Horticulture and viticulture. 2015;(5):22-25. (In Russ.)
Views:
380
Email this article 