Апробация различных методик выделения возбудителя бактериоза винограда (болезнь Пирса) Xylella fastidiosa Wells et al. в ходе научно-исследовательского мониторинга в условиях Республики Крым

Возбудитель бактериоза винограда (болезнь Пирса) Xylella fastidiosa Wells et al. является одной из самых опасных и вредоносных фитопатогенных бактерий, поражающих широкий спектр растений, относящихся как к важным сельскохозяйственным культурам, так и к декоративным растениям. Бактерия колонизирует ткани ксилемы растения и распространяется насекомыми-переносчиками, питающимися ксилемным соком. Переносчиками X. fastidiosa являются насекомые, отряда Hemiptera, подотряда Auchenorrhyncha, семейств Cicadellidae, Cercopidae, Aphrophoridae и Cicadidae. По данным анализа фитосанитарного риска, проведенного специалистами Всероссийского научно-исследовательского института карантина растений (ВНИИКР) в 2014 г., был определен высокий уровень опасности интродукции и адаптации X. fastidiosa на территории Российской Федерации. Крымский полуостров является зоной возможной интродукции возбудителя болезни Пирса в связи с климатическими условиями региона, наличием большого количества основных растений-хозяев, а также насекомыхпереносчиков. С 2018 по 2020 гг. сотрудниками ВНИИКР проводилась оценка фитосанитарного состояния территории Республики Крым в рамках научно-исследовательской работы. Для исследований отбирались образцы вегетативных частей винограда, косточковых культур (персик, вишня, слива, черешня, миндаль), некоторых эфиромасличных и декоративных кустарниковых и древесных растений. Исследования отобранных образцов проходили в соответствии с международными диагностическими стандартами. Оценка фитосанитарного состояния насаждений в Республике Крым в течение трех лет показала отсутствие возбудителя X. fastidiosa на данной территории. Были апробированы две различные методики подготовки проб и выделения ДНК из разных субстратов. Проведение теста на основе ПЦР «в реальном времени» показало его высокую специфичность, так как ложноположительных или неспецифических результатов тестирования получено не было.

1. Elbeaino T., Valentini F., Kubaa R. A., Moubarak P., Yaseen T., Digiaro M. Multilocus sequence typing of Xylella fastidiosa isolated from olive affected by “olive quick decline syndrome” in Italy. Phytopathologia Mediterranea, 2015;53(3):533-542. DOI: 10.14601/Phytopathol_Mediterr-15000

2. Loconsole G., Saponari M., Boscia D., D’Attoma G., Morelli M., Martelli G. P., Almeida R. P. P. Intercepted isolates of Xylella fastidiosa in Europe reveal novel genetic diversity. European Journal of Plant Pathology. 2016;146:85-94.

3. Almeida R. P. P., Nunney L. How Do Plant Diseases Caused by Xylella fastidiosa Emerge? Plant disease, 2015;99(11):1457-1467. doi: 10.1007/s10658-016-0894-x

4. Глобальная база данных ЕОКЗР [Global EPPO Database]: Xylella fastidiosa. URL: https://gd.eppo.int/taxon/XYLEFA/datasheet

5. Saponari M., Boscia D., Altamura G., Loconsole G. M., Zicca S., D’Attoma G., Morelli M., Palmisano F., Saponari A., Tavano D., Savino V. N., Dongiovanni C., Martelli G. P. Isolation and pathogenicity of Xylella fastidiosa associated to the olive quick decline syndrome in southern Italy. Scientific reports, 2017;7:1-13. DOI: 10.1038/s41598-017-17957-z

6. Crop Protection Compendium CABI, 2020. URL: https://www.cabi.org

7. Amanifar N., Babaei G., Mohammad A. H. Xylella fastidiosa causes leaf scorch of pistachio (Pistacia vera) in Iran. Phytopathologia Mediterranea, 2019;58(2):369-378. doi: 10.14601/Phytopathol_Mediter-10623

8. Amanifar N., Taghavi M., Izadpanah K., Babaei G. Isolation and pathogenicity of Xylella fastidiosa from grapevine and almond in Iran. Phytopathologia Mediterranea, 2014;53:318-327. doi: 10.14601/Phytopathol_Mediterr-12647

9. Denance N., Legendre B., Briand M., Olivier V., de Boisseson C., Poliakoff F., Jacques M.-A. Several subspecies and sequence types are associated with the emergence of Xylella fastidiosa in natural settings in France. Plant Pathology, 2017;66:1054-1064. doi: 10.1111/ppa.12695

10. Landa B. B., Castillo Siri A., Giampetruzzi A., Román M., Velasco M. P., Marco-Noales E., Moralejo E., Saponari M., Navas-Cortés J. A., Almeida R. P. P. Understanding the potential origin and epidemiological consequences of the Spanish outbreaks caused by Xylella fastidiosa subspecies multiplex. Abstracts Book of 2nd European Conference on Xylella fastidiosa, 2019: p. 18-19. doi: 10.1073/pnas.1912206117

11. Update of the Xylella spp. host plant database — systematic literature searches up to 30 June 2019. Scientific report, EFSA, 2020: p. 1-61.

12. EPPO Diagnostic Protocol PM 7/024 (4) Xylella fastidiosa. Diagnostic protocol. Bulletin OEPP / EPPO Bulletin, 2019;49(2):175-227.

13. Шнейдер Е. Ю., Каримова Е. В. Анализ фитосанитарного риска возбудителя болезни Пирса Xylella fastidiosa Wells et al. для территории Российской Федерации. 2014: с. 4-31.

14. Loconsole G., Saponari M., Boscia D., D’Attoma G., Morelli M., Martelli G. P., Almeida R. P. P. Intercepted isolates of Xylella fastidiosa in Europe reveal novel genetic diversity. European Journal of Plant Pathology, 2016;146:85-94.

15. Commission database of host plants found to be susceptible Xylella fastidiosa in the Union territory — 12 update. Ref. Ares. 2019. doi: 10.1007/s10658-016-0894-x

16. Писарева И. Н., Приходько С. И., Корнев К. П. Поиск оптимального метода выделения ДНК из образцов растений оливы европейской (Olea europaea L.) инфицированных Xylella fastidiosa Wells et al. Карантин растений. Наука и практика, 2019;4(30):30-33.

17. Almeida R. P. P. Xylella fastidiosa. Vector Transmission Biology, 2016:165-173.

18. Saponari M., Giampetruzzi A., Loconsole G., Boscia D., Saldarelli P. Xylella fastidiosa in Olive in Apulia: Where We Stand. Phytopathology, 2019;109(2):175-186. DOI: 10.1094/PHYTO-08-18-0319-FI

19. Радионовская Я. Э., Диденко Л. В. Изучение видового разнообразия цикадовых (Auchenorrhyncha) на виноградных насаждениях Крыма. Повышение эффективности инновационных процессов в садоводстве и виноградарстве: Науч. тр. СКЗНИИСиВ. Краснодар, 2015;8:205-215.

20. Стрюкова Н. М., Стрюков А. А. Новый вид для энтомофауны Крыма — цикадка белая или цитрусовая Metcalfa pruinosa (Say, 1830) (Auchenorrhyncha: Flatidae). Актуальные проблемы и перспективы интегрированной защиты плодовых, декоративных и лесных культур. Международная научно-практ. конф. (Ялта, 12-16 октября 2020 г.). 2020: с. 70-73.

21. Sicard A., Zeilinger A. R., Vanhove M., Schartel T. E., Beal D. J., Daugherty M. P., Almeida R. P. P. Xylella fastidiosa: Insights into an Emerging Plant Pathogen. Annu. Rev. Phytopathol., 2018;56:181-202. DOI: 10.1146/annurev-phyto-080417-045849

22. Baldi P., La Porta N. Xylella fastidiosa: Host Range and Advance in Molecular Identification Techniques. Front. Plant Sci., 2017;8:1-22. DOI: 10.3389/fpls.2017.00944

23. Климатический атлас Крыма. Приложение к научно-практическому дискуссионно-аналитическому сборнику «Вопросы развития Крыма». Симферополь: Таврия-Плюс, 2000, 120 с.

24. Карта климатических зон Крыма URL: https://visasam.ru/russia/goroda/na-pmzh-v-kerch.html

25. Шнейдер Е. Ю., Каримова Е. В. Возбудитель заболевания Xylella fastidiosa — потенциально опасный для Российской Федерации и стран ЕАЭС бактериоз. Карантин растений. Наука и практика, 2018;1(23):14-18.