Распространенность вирусов косточковых культур в некоторых субъектах России и генетический анализ изолятов PNRSV

В рамках научного мониторинга, осуществляемого ФГБУ «ВНИИКР», проведено тестирование методом иммуноферментного анализа образцов косточковых культур, отобранных на территории 20 субъектов Российской Федерации на наличие следующих вирусов: ACLSV, ApMV, APLPV, ArMV, CLRV, CRLV, PBNSPaV, PDV, PNRSV, PPV, PRMV, RpRSV, SLRSV, TBRV, ToRSV и TRSV. Установлено распространение потивируса шарки слив (PPV), иларвируса некротической кольцевой пятнистости косточковых (PNRSV) и иларвируса карликовости сливы (PDV), которые были выявлены на территории 12, 12 и 8 субъектов Российской Федерации, соответственно в 14,9 %, 11,9 % и 1,7 % тест-образцах. Наличие этих вирусов было подтверждено методом полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием полученных продуктов амплификации. Проведен анализ встречаемости этих вирусов в зависимости от типа насаждений, видов растений и региона. Проведен анализ участка гена белка оболочки 18 изолятов PNRSV из пяти субъектов Российской Федерации, который показал значительную генетическую вариабельность российской популяции этого вируса. 

1. Приходько Ю. Н., Мазурин Е. С., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А., Соколова Е. Е. Изучение штаммов вируса шарки сливы // Защита и карантин растений. – 2011. – № 11. – С. 29-32.

2. Приходько Ю. Н., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А. Скрининговые методы выявления комплекса штаммов вируса шарки слив (PPV) // Садоводство и виноградарство. – 2019. – № 1 – С. 36-42.

3. Rowhani A., Biardi L., Routh G., Daubert S. D., Golino D. A. Development of a sensitive colorimetric-PCR assay for detection of viruses in woody plants // Plant Disease. – 1998. – Vol. 82. – P. 880-884.

4. Marbot S., Salmon M., Vendrame M., Huwaert A., Kummert J., Dutrecq O. and Lepoivre P. Development of real-time RTPCR assay for detection of Prunus necrotic ringspot virus in fruit trees // Plant Disease. – 2003. – Vol. 87. – P. 1344-1348.

5. Приходько Ю. Н., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А., Морозова О. Н., Мазурин Е. С. Выявление в Российской Федерации нового штамма вируса шарки слив – CherryRussian (CR) // Карантин растений. Наука и практика. – 2013а. – № 2(4). – C.18-33.

6. Приходько Ю. Н., Живаева Т. С., Шнейдер Ю. А., Морозова О. Н. Распространенность, диагностика и штаммовый состав вируса шарки слив (PPV) // Фитосанитарная оптимизация агроэкосистем // Материалы III Всероссийского съезда по защите растений. – Санкт-Петербург. – 2013б. – Т.1. – С. 265-268.

7. Чирков С. К., Приходько Ю. Н. Генетическое разнообразие и структура популяции вируса оспы (шарки) сливы в России // Сельскохозяйственная биология. – 2015. – Т. 50, № 5. – С. 529-539.

8. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Kudryavtseva F., Prikhodko Y., Mitrofanova I. Occurrence and characterization of plum pox virus strain D isolates from European Russia and Crimea // Arch. Virol. – 2016. – Vol. 161. – P. 425-430.

9. Glasa M., Prikhodko Y., Predajňa L., Nagyová A., Shneyder Y., Zhivaeva T., Šubr Z., Cambra M., Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga Basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus // Phytopathology. – 2013. – Vol. 103, № 9. – Р. 972-979.

10. Prikhodko Yu., Shneider Yu., Zhivaeva T., Morozova O. The PPV-W strain in Russia: distribution and identifi cation // Book of Abstracts 3rd International Symposium on Plum pox virus. – Antalya, Turkey, 9-13 May 2016. – P. 45-46.

11. Приходько Ю. Н., Магомедов У. Ш. Вирусы семечковых и косточковых плодовых культур. Воронеж, «Научная книга». – 2011. – 468 с.

12. EPPO, 2023. EPPO Global Database. https://gd.eppo.int. (дата обращения: 31.05.2023).