SSR-фингерпринтинг и оценка генетических взаимосвязей сортов персика современной селекции Никитского ботанического сада


https://doi.org/10.18454/VSTISP.2017.5.7586

Полный текст:


Аннотация

С использованием анализа полиморфизма микросателлитных локусов выполнена ДНК-паспортизация и оценка степени генетического сходства выборки из 20 современных сортов персика селекции Никитского ботанического сада. Исследованные сорта являются востребованными в садоводстве в агроклиматических условиях региона и представляют селекционный интерес как источники полезных адаптивных признаков. Для анализа полиморфизм исследуемых сортов использовали 13 SSR-маркеров: BPPCT025, CPPCT044, BPPCT007, CPPCT006, UDP96-018, BPPCT023, UDP98-410, CPPCT040, UDP98-409, BPPCT017, BPPCT028, UDP98-412 и BPPCT002. Маркеры были распределены в мультиплексные наборы, включающие 3-4 маркера. Оптимальные сочетания SSR-маркеров позволили получать легко интерпретируемые результаты в ходе фрагментного анализа. Среди использованных SSR-маркеров наибольшее количество аллелей (5) было выявлено для маркеров BPPCT 025 и CPPCT 044, наименее полиморфными оказались маркеры CPPCT 040, UDP 98-409, BPPCT 028 (2 аллеля) и BPPCT002 (1 аллель). По остальным SSR-маркерам было выявлено по 3-4 аллеля на локус. Анализ полученных ДНК-фингерпринтов показал, что все изученные сорта обладают уникальным аллельным набором. Наиболее полиморфные SSR-маркеры перспективны для использования при ДНК-паспортизации генетических ресурсов персика. Выполненный кластерный анализ выявил три главных кластера, распределение в которых в ряде случаев согласуется с происхождением сортов. Данные о степени генетического сходства в совокупности с данными о происхождении сортов могут быть использованы для планирования комбинаций скрещиваний при необходимости получения максимального уровня разнообразия в гибридном потомстве.

Об авторах

И. И. Супрун
ФГБНУ «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия


А. В. Смыков
ФГБУН «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический сад - Национальный научный центр РАН»
Россия


С. В. Токмаков
ФГБНУ «Северо-Кавказский федеральный научный центр садоводства, виноградарства, виноделия»
Россия


Список литературы

1. Исследования выполнены на оборудовании ЦКП «Геномные и постгеномные технологии», ФГБНУ СКФНЦСВВ

2. Смыков А. В., Федорова О. С., Шишова Т. В., Иващенко Ю. А. Селекция персика и ее результаты // Сб. научн. тр. ГНБС, 2015. - Т. 140. - С. 24-33.

3. Aranzana M. J., Abbassi El-K., Howad W., Arus P. Genetic variation, population structure and linkage disequilibrium in peach commercial varieties // BMC Genetics, 2010. - Vol. 11:69. doi: 10.1186/1471-2156-11-69.

4. Zhongping C., Hongwen H. SSR fingerprinting of chinese peach cultivars and landraces (Prunus persica) and analysis of their genetic relationships // Scientia Horticulturae, 2009. - Vol. 120. - P. 188-193.

5. Aranzana M. J., Carbу J., Arus P. Microsatellite variability in peach [Prunus persica (L.) Batsch]: cultivar identifi cation, marker mutation, pedigree inferences and population structure // Theoretical and Applied Genetics, 2003. - Vol. 106. - P. 1341-1352.

6. Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana M. J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach [Prunus persica (L.) Batsch] and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.) // Theoretical and Applied Genetics, 2002. - Vol. 125. - P. 127-138.

7. Bouhadida M., Casas A. M., Gonzalo M. J., Arus P., Moreno M. A., Gogorcena Y. Molecular characterization and genetic diversity of Prunus rootstocks // Scientia Horticulturae, 2009. - Vol. 120. - P. 37-245.

8. Супрун И. И., Токмаков С. В., Степанов И. В., Балапанов И. М. Разработка мультиплексных наборов SSRмаркеров для использования в изучении генетического разнообразия в пределах родов Malus, Prunus и Pyrus // Методологическое обеспечение селекции садовых культур и винограда на современном этапе: науч. труды ГНУ СКЗНИИ- СиВ, 2013. - Т. 1. - С. 97-101.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Супрун И.И., Смыков А.В., Токмаков С.В. SSR-фингерпринтинг и оценка генетических взаимосвязей сортов персика современной селекции Никитского ботанического сада. Садоводство и виноградарство. 2017;(5):23-27. https://doi.org/10.18454/VSTISP.2017.5.7586

For citation: Suprun I.I., Smykov A.V., Tokmakov S.V. SSR-fi ngerprinting and estimation of genetic relationship of peach varieties of Nikita botanical gardens’ modern breeding. Horticulture and viticulture. 2017;(5):23-27. (In Russ.) https://doi.org/10.18454/VSTISP.2017.5.7586

Просмотров: 62


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0235-2591 (Print)
ISSN 2618-9003 (Online)