Полиморфизм микросателлитных локусов сортов вишни (Prunus cerasus L.) современной селекции Всероссийского селекционно-технологического института садоводства и питомниководства


https://doi.org/10.31676/0235-2591-2018-5-5-9

Полный текст:


Аннотация

Плодовые культуры рода Prunus (персик, слива, абрикос, черешня, вишня, миндаль) имеют большое экономическое значение. Среди наиболее изученных представителей рода можно выделить персик (P. persica), для которого были разработаны серии SSR-маркеров, впоследствии успешно примененные и для исследования других видов Prunus. Микросателлитные маркеры успешно использовались и для исследования генетического разнообразия и паспортизации американской коллекции тетраплоидной вишни, коллекций сортов вишни из Латвии и Ирана. Однако следует отметить, что отечественный генофонд вишни мало изучался с использованием современных молекулярно-генетических подходов. Работа по фенотипической оценке сортов вишни селекции Всероссийского селекционно-технологического института садоводства и питомниководства проводится на протяжении многих лет. В результате изучения выделены растения, для которых стало актуальным получение идентификационных паспортов с использованием ДНК маркеров. Целью данной работы было SSR-генотипирование 10 сортов вишни селекции и оценка их генетического разнообразия на базе Института общей генетики им. Н. И. Вавилова Российской академии наук. Для анализа были выбраны 6 SSR-маркеров: UDP96-001, UDP96-003, UDP96-005, UDP97-402, UDP97-403, UDP98-406,по каждому из которых получены четкие и воспроизводимые результаты фрагментного анализа. В результате было выявлено 28 аллелей по шести изученным локусам. Количество аллелей на локус варьировало от 4 (UDP96-001, UDP96-003, UDP97-403) до 6 (UDP97-402), и в среднем составило 4,7 аллелей на локус. Значение показателя информативности (PIC) в среднем составило 0,64. Выбранные маркеры оказались достаточно эффективны для исследования генетического разнообразия отечественных сортов вишни обыкновенной. Для каждого сорта показано наличие уникальной для данной выборки комбинации аллелей, которая может быть использована для идентификации и паспортизации данных сортов. Полученные результаты также могут быть использованы для сохранения и поддержания генетической коллекции косточковых.


Об авторах

И. М. Куликов
ФГБНУ «Всероссийский селекционно-технологический институт садоводства и питомниководства»
Россия

Академик РАН, директор 

г. Москва



В. М. Кудрявцев
ФГБУН «Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН»
Россия

Доктор биологических наук, директор 

г. Москва



Л. А. Марченко
ФГБНУ «Всероссийский селекционно-технологический институт садоводства и питомниководства»
Россия

Кандидат сельскохозяйственных наук, зам. директора по научной работе 

г. Москва



Н. Г. Морозова
ФГБНУ «Всероссийский селекционно-технологический институт садоводства и питомниководства»
Россия

Кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник 

г. Москва



К. В. Борис
ФГБУН «Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН»
Россия

Кандидат биологических наук, научный сотрудник 

Aдрес для переписки: Борис Ксения Витальевна – ФГБУН «Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН», 119991, Россия, ГСП-1 Москва, ул. Губкина, д. 3.



А. А. Трифонова
ФГБУН «Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН»
Россия

Младший научный сотрудник 

г. Москва



Л. В. Дедова
ФГБУН «Институт общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН»
Россия

Младший научный сотрудник 

г. Москва



Список литературы

1. Куликов И. М., Марченко Л. А. Значение генетических коллекций плодовых культур для инновационного развития отрасли, Вестник Российской академии наук. 2015; 85(1):18-18.

2. Куликов И. М., Морозова Н. Г., Симонов В. С., Сорокопудова О. А. Развитие научной школы по садоводству профессора В. В. Кичины, выдающегося генетика и селекционера, Плодоводство и ягодоводство России. 2017;49:186-195.

3. Cipriani G., Lot G., Huang W. G., Marrazzo M. T., Peterlunger E., Testolin R. AC/GT and AG/CT microsatellite repeats in peach (Prunus persica (L) Batsch): isolation, characterisation and cross-species ampli fi cation in Prunus, Theoretical and Applied Genetics. 1999;99:65-72.

4. Dirlewanger E., Cosson P., Tavaud M., Aranzana J., Poizat C., Zanetto A., Arús P., Laigret F. Development of microsatellite markers in peach (Prunus persica (L.). Batsch) and their use in genetic diversity analysis in peach and sweet cherry (Prunus avium L.), Theoretical and Applied Genetics. 2002;105(1):127-138.

5. Aranzana M. J., Carbó J., Arús P. Microsatellite variability in peach (Prunus persica (L.) Batsch): cultivar identi fi cation marker mutation pedigree inferences and population structure. Theoretical and Applied Genetics. 2003;106(8):1341-1352.

6. Cantini C., Iezzoni A.F., Lamboy W. F., Boritzki M., Struss D. DNA Fingerprinting of Tetraploid Cherry Germplasm Using Simple Sequence Repeats. Journal of American Society of Horticultural Sciences. 2001;126(2):205-209.

7. Lacis G., Kota I. SSR marker-based fi ngerprinting for sour cherry (Prunus cerasus) genetic resources identi fi cation and management, XIII Eucarpia Symposium on Fruit Breeding and Genetics 2011;976:251-256.

8. Najafzadeh R., Arzani K., Bouzari N., Saei A. Genetic variation and identi fi cation of promising sour cherries inferred from microsatellite markers, Russian Journal of Genetics. 2016;52(1):64-73.

9. Doyle J. DNA Protocols for Plants, Molecular Techniques in Taxonomy NATO ASI Series. 1991;57:283-93.

10. Peakall R., Smouse P. E. GenALEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics. 2012;28(19):2537-2539.

11. Nagy S., Poczai P., Cernak I., Gorji A.M., Hegedus G., Taller J. PICcalc: an online program to calculate polymorphic information content for molecular genetic studies. Biochemical Genetics. 2012;50:670-672.

12. Урбанович О. Ю., Кузмицкая П. В., Козловская З. А., Таранов А. А. Разнообразие SSR-аллелей сортов вишни обыкновенной (Prunus cerasus). Вестник национальной академии наук Беларуси. 2014;2:64-69.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Куликов И.М., Кудрявцев В.М., Марченко Л.А., Морозова Н.Г., Борис К.В., Трифонова А.А., Дедова Л.В. Полиморфизм микросателлитных локусов сортов вишни (Prunus cerasus L.) современной селекции Всероссийского селекционно-технологического института садоводства и питомниководства. Садоводство и виноградарство. 2018;(5):5-9. https://doi.org/10.31676/0235-2591-2018-5-5-9

For citation: Kulikov I.M., Kudryavtsev A.M., Marchenko .A., Morozova N.G., Boris K.V., Trifonova A.A., Dedova L.V. Microsatellite loci polymorphism in contemporary Russian sour cherry (Prunus cerasus L.) varieties bred in All-Russian Horticultural Institute for Breeding, Agrotechnology and Nursery. Horticulture and viticulture. 2018;(5):5-9. (In Russ.) https://doi.org/10.31676/0235-2591-2018-5-5-9

Просмотров: 145


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0235-2591 (Print)
ISSN 2618-9003 (Online)