Таксономический состав эндофитного бактериального компонента микробиома растительных тканей клоновых подвоев яблони, выращиваемых на дерново-подзолистых почвах с различными свойствами

Аннотация

Проведено сравнительное изучение таксономического состава эндофитного бактериального компонента микробиома микрорастений (недифференцированная каллусная ткань растительных эксплантов, 25-й пассаж) и растений 5-летнего возраста клоновых подвоев яблони 57-490 и 54-118, выращенных из соответствующей культуры тканей (1-й пассаж) на дерново-подзолистых почвах разного гранулометрического состава с различными химическими, физико-химическими и физическими свойствами. Преобладающими филумами эндофитных бактерий растительных тканей у подвоя 57-490 в культуре in vitro является Proteobacteria (91,6 %), у подвоя 54-118 — Proteobacteria (52,5 %) и Firmicutes (47,4 %). Относительное количество эндофитных бактерий филума Firmicutes по сравнению с культурой in vitro снижается в корнях до 0,7-2,0 %, ещё более значительно — в листьях (до 0-0,2 %). При выращивании на тяжелосуглинистой почве в корнях изученных подвоев обнаруживаются эндофитные бактерии, относящиеся к филуму Actinobacteriota (11,7 %), относительное содержание которых при выращивании на среднесуглинистой почве в корнях снижается до 2,7-4,1 %, в листьях — до 0,1-0,2 %. Оценка разнообразия основных филумов эндофитных бактерий растительных тканей подвоев яблони по филогенетическим индексам свидетельствует о том, что в эндосфере культуры in vitro разнообразие и выравненность сообщества представителей основных филумов эндофитных бактерий существенно ниже (индекс Шеннона 0,42-1,00), чем в корнях подвоев, выращиваемых в открытом грунте (1,34-2,08). Для листьев индекс Шеннона характеризуется низкими значениями (0,06-0,13), что свидетельствует о незначительном разнообразии и слабой выравненности численности основных филумов эндофитных бактерий.